撇开个人的人际色彩，单从组织内部的部门来看，直线部门与职能部门的权力冲突、博弈是普遍存在的。从部门关系的角度看，直线部门与职能部门的划分是相对于整个组织而言的，二者通过实现组织目标发生联系。直线部门要为组织目标的实现做直接贡献，而职能部门通过提供意见与建议，保证组织目标能更有效地实现。在思考问题时，由于二者出发点不同，在采用的手段上可能就会存在差异。例如，同样是想拿下竞争对手的“阵地”，直线部门会想不惜一切代价地用炮火覆盖，职能部门就会先算账，希望能更精准地打击对手。

沈阳众森企业管理咨询公司看到，从部门权力的角度看，直线部门与职能部门有很大不同。直线权力表现为，在接到相关指令信息后，他们必须按照规定执行；而职能权力表现为，接到相关指令信息后，他们可以采纳这个信息所包含的内容，也可以不采纳。直线部门需要职能部门的帮助，以此做出正确的决策，而职能部门需要直线部门的支持，才能行使权力。

这就好像大部分相声表演由逗哏和捧哏构成，二者或许有主次之分，但都不可或缺。处理好直线部门和职能部门之间的关系非常重要。直线部门做出决策、发布命令并付诸实施，直线职权必须得到保障，这样组织内部才能实现统一指挥的状态。职能部门从专业角度保障直线部门的决策不仅是正确的，而且是高效的，毕竟企业追求效率和效益。

此外，为了使下级直线人员在一些特殊问题上能做出更合理的决策，上级直线指挥人员可以授权相应的职能部门，要求下级直线人员在采取具体行动前，必须事先和该部门商量，否则不予批准，以加强职能人员的发言权和影响力。强制性磋商制度可以让直线部门更冷静、全面地思考重大问题。